Una poderosa alianza entre la ciencia y la industria está redefiniendo el futuro de la acuicultura. Investigadores del Centro Incar, el Centro de Biotecnología de la USS y la empresa MOWI Chile han demostrado cómo la secuenciación genética de última generación puede convertirse en el guardián invisible de la salud de los peces.
La Revolución Nanopore en Sistemas RAS
El foco del estudio se centró en los Sistemas de Acuicultura con Recirculación (RAS), un modelo más sustentable que reutiliza el agua, pero que exige un control sanitario implacable. Tradicionalmente, la detección de bacterias se hacía con métodos limitados como la PCR, que no logran capturar la compleja diversidad microbiana del entorno.
El equipo multidisciplinario —liderado por figuras como el Dr. Diego Valenzuela-Miranda y el Dr. Cristian Gallardo-Escárate— desplegó el Oxford Nanopore, una herramienta de secuenciación portátil y ultrarrápida, para realizar una inspección profunda en una instalación de cultivo de salmón del Atlántico.
La Ventaja de la Rapidez: «Una de las ventajas de Nanopore es que permite leer el gen 16S completo, identificando bacterias hasta nivel de especie, algo que no se logra con otras tecnologías… En menos de un día podemos tener un panorama completo de la comunidad microbiana, incluyendo patógenos,» explicó el Dr. Valenzuela-Miranda.
El Retrato Microbiológico de la Enfermedad
Los resultados, publicados en el paper ‘Nanopore-Based Metagenomic Approaches…’, pintaron un cuadro microbiológico detallado y crucial.
- Patógenos Ocultos: Se detectaron bacterias patógenas como Aeromonas, Vibrio y Aliivibrio. Específicamente, encontraron a Aliivibrio wodanis en los peces enfermos.
- La Firma de la Salud: Los salmones saludables mostraron una mayor diversidad microbiana y rutas metabólicas asociadas a una mejor digestión. En contraste, los peces con síntomas clínicos presentaban una menor diversidad y dominancia del grupo Proteobacteria.
- Reservorios Ambientales: El hallazgo más alarmante fue la presencia de Aliivibrio wodanis no solo en los peces, sino también en el agua del sistema. «Esto demuestra que los biofiltros y tanques pueden actuar como reservorios de patógenos, por lo que es clave monitorear no solo los peces, sino también el entorno microbiológico del RAS,» detalló el Dr. Valenzuela-Miranda.
Hacia una Acuicultura Preventiva
La conclusión es una invitación a la innovación. Si tecnologías como Nanopore se incorporan al monitoreo rutinario, la industria acuícola podría dejar de ser reactiva.
«Si incorporamos esta tecnología al monitoreo rutinario, podríamos anticipar brotes y actuar preventivamente, reduciendo el uso de antibióticos y mejorando la salud de los peces y del sistema,» concluyen los investigadores.
La secuenciación genética no es solo una herramienta de laboratorio; es un sistema de alerta temprana que promete una producción de salmón más segura, sana y sostenible.
SOJ
